配位化学国家重点实验室于1988年在南京大学配位化学研究所的基础上建立，1990年起向国内外开放，1991年通过国家验收。1994年被国家教委评估为A级实验室，1995年在国家联合评估中被评为A级实验室;1999年、2004年和2009年分别被评为良好类实验室。实验室于2004年荣获"国家重点实验室计划先进集体"称号，2009年荣获全国教育系统先进集体称号。实验室现有研究人员42人，其中中科院院士1人，***2名，讲座教授3名，国家***基金获得者7名。现任学术委员会名誉主任为游效曾院士, 学术委员会主任为高松院士，学术委员会副主任为陈小明院士和郭子建教授。现任实验室主任为左景林教授。
实验室立足于基础研究，主要学术方向是与材料科学和生命科学密切相关的功能配合物化学、生物无机化学、金属有机化学和纳米材料化学。在功能配合物化学方面，着重研究分子基材料的组装，探索新型分子基信息存储材料、与能源相关的光电转换和能量存储材料、吸附分离材料、催化材料、分子电子器件等;在生物无机化学方面，着重合成具有生物活性的配合物分子，深入研究金属生物大分子的结构，希望在金属药物的设计、合成以及金属酶的模拟等方面取得突破性进展;在固体无机化学和表面化学研究方面，主要是探索新的合成方法，制备新颖的低维、层状和多孔固体材料，研制具有应用前景的有序纳米材料等。
自建成以来，实验室承担了国家973或重大科学计划项目5 项，国家攀登计划3项，863项目7项，国家自然科学基金的重大项目7项、重大研究计划项目 3 项、优秀创新群体项目1项、重点项目27项和面上基金项目190余项，横向项目20 余项等。共计发表学术论文2600余篇，其中SCI论文2400余篇，专著7本。获得国家自然科学二等奖2项，国家自然科学三等奖1项，教育部提名国家科学技术自然科学一等奖5项、二等奖3项，国家教委科技进步一等奖1项、二等奖5项，国家优秀教材奖3项，亚洲化学会基础研究报告奖1项，何梁何利科学与技术进步奖1项等。毕业生中4人次获得全国百篇优秀博士论文奖。
实验室现有现代化大型仪器：MPMS XL-7T型超导量子干涉磁性测量仪，500兆DRX超导核磁共振仪，MALDI-TOF MASS型基质辅助激光解析电离飞行时间质谱, LCQ电喷雾质谱仪，CCD和四圆单晶X-射线衍射仪，激光拉曼光谱仪，皮秒级荧光光谱仪、原子力显微镜、微孔物理和化学吸附仪、铁电材料测试仪等。实验室每年批准开放课题约20项，并设有客座人员实验室，可接纳客座人员20人/年，并可接待获得国家教育部资助的高级访问学者5人/年。
